Szuperszámítógéppel derítették ki, hogyan támadja meg a koronavírus az egészséges sejteket
A világ egyik legerősebb szuperkomputerével, a Summittal mindez idáig több mint 40 ezer gént és 17 ezer COVID-19-cel kapcsolatos mintát elemeztek – ezzel kívánnak tisztább képet kapni arról, miként fertőz a kórokozó.
A világ egyik legerősebb szuperkomputerével, a Summittal mindez idáig több mint 40 ezer gént és 17 ezer COVID-19-cel kapcsolatos mintát elemeztek – ezzel kívánnak tisztább képet kapni arról, miként fertőz a kórokozó.
Dan Jacobson, a tanulmány vezetője és a Tennesseeben található Oak Ridge Nemzeti Energetikai Laboratóriumának (ORNL) professzora elmondta, az informatika és a genetika tudományága pandémia idején igencsak összeért, ami jó hír, hiszen egyre több mindent tudhatnak meg a koronavírus rejtélyes viselkedéséről – számolt be róla a Sputnik News.
„Néztem az adatokat, egyszer csak egy igen különös mintázatot fedeztem fel a renin-angiotenzin és a bardikinin rendszerek pályáiban. Ezután tüzetesebb vizsgálatokba kezdtünk azon géncsoportoknál, amelyek a vérnyomás-szabályozó rendszerért felelősek.”
Az elhalálozások főként az úgynevezett citokin vihar következtében történhetnek meg. Ez lényegében a szervezett túlzott immunreakciója a behatoló vírusra, ami miatt az immunrendszert kontrolláló apró fehérjékből, a citokinekből túltermelődés jelentkezik.
A citokin vihart okolják bizonyos fertőzések, úgymint az influenza vagy a jelenlegi koronavírus magasabb halálozási rátájáért, de előfordulhat azoknál az egyébként egészséges fiataloknál is, akik nagyon erős immunrendszerrel rendelkeznek.
Korábbi kutatások során azt nézték meg, összefüggésben állhat-e a citokin vihar a COVID-19 jellegzetes tüneteivel, úgymint a szaglásvesztéssel, a bőrfelszínen kialakuló kiütésekkel (az ún. COVID-lábujjakkal), valamint a szívkárosodással.
Jacobson és társai azonban úgy gondolják, hogy a bradikinin útvonal állhat a folyamatok hátterében, ami a renin-angiotenzin rendszerrel együtt a vérnyomást és a folyadék-egyensúlyt szabályozza.
„Úgy hisszük, ha elzárjuk ennek a pályának a csúcsát, akkor egy kontrollálatlan káosz alakul ki, ami a vérerek felszakadásához és szivárgáshoz vezethet. Ha ugyanez megy végbe a tüdőkben, az nyilván nem jó hír. Az immunsejtek általában a véredényekben vannak, így viszont megtelítik a fertőzött szöveteket és gyulladásokat okozhatnak.”
Jacobson és kollégái a Summit eszméletlen teljesítményének köszönhetően 2,5 milliárd korrelációs számítást hajtottak végre, amivel pontosabban megérthették a normális szabályozási útvonalak és a szóban forgó gének kapcsolatát.
Ha Jacobsonéknak igazuk van, és valóban a bradikinin rendszer okolható a tünetek súlyosbodásáért, akkor legalább 10 manapság is alkalmazott gyógyszerrel gátolhatják meg ezen útvonalakat, viszont előtte humán klinikai kísérleteken lesz szükséges tesztelni a hatékonyságukat.
