Százezernél is több új vírust fedezett fel egy szuperszámítógép, köztük 9 új koronavírust
A kutatás során létrehozott adatbázis segíti a vírusok könnyebb felismerését, ezáltal az ismeretlen eredetű fertőzésben szenvedő páciensek kezelését is hatékonyabbá teszi.
Fotó: PentiumIII / Twenty20A Serratus Projekt nevű nemzetközi együttműködés során csaknem 20 millió gigabájtnyi RNS-szekventálási adatot elemeztek újra, a folyamat során pedig csaknem tízszer annyi RNS-vírust fedeztek fel, mint amennyi korábban ismert volt. A vizsgálat során 9 új koronavírus típust is találtak – számolt be a TweakTown.
Az elemzést egy 22 500 processzor erejével rendelkező szuperszámítógép végezte, az 5,7 millió biológiai mintát pedig a Cloud Innovation Center (CIC) biztosította a kutatás számára az elmúlt 13 évből. A vizsgálat során 132 ezer RNS-vírust találtak, amelyek közül csak 15 ezret azonosítottak korábban.
Dr. Arthem Babaian, a kutatás vezetője úgy becsülte, egy hagyományos szuperszámítógép több mint egy év alatt, több százezer dolláros költséggel végezte volna el ugyanezt a feladatot. Ezzel szemben a Serratus 11 nap alatt végzett az elemzéssel, a kutatás pedig 24 ezer dollárba került.
„Új korszakba lépünk a természetben előforduló vírusok genetikai és térbeli sokféleségének megértésével, valamint azzal, hogy érintkezik a sokféle állatfaj ezekkel a vírusokkal. Azt reméljük, nem ér váratlanul minket, ha újra felbukkan egy a COVID-19 járványt okozó SARS-CoV-2 vírushoz hasonló fenyegetés. Ezek a vírusok könnyebben felismerhetővé váltak, a természetes hordozóik pedig gyorsabban azonosíthatóbbak lettek. A fő cél az, hogy a fertőzéseket olyan korán felismerjük, hogy ne okozhassanak pandémiát”
– nyilatkozta Babaian.
A szakember kifejtette, az új adatbázis jelentősen megkönnyíti az ismeretlen eredetű betegségben szenvedő páciensek kezelését, a vérükből kinyert vírus ugyanis egy egyszerű kereséssel összekapcsolhatóvá válik a világszerte feljegyzett hasonló esetekkel.
